SKTK:n nuorisotyötä tehdään kolmella tasolla: valtakunnallisella ja alueellisella tasolla sekä yksittäisissä seurakunnissa.

Koko nuorisotyö perustuu rippikoulutyöhön. Seurakuntatason nuorisotyö koostuu nuorten kanssa toteutetuista jumalanpalveluksista, joihin kutsutaan erityisesti vuoden rippikoululaisia.

Valtakunnallisen tason toiminnan peruspilari on isoskoulutus, johon nuoria kutsutaan mukaan konfirmaation jälkeen. Isoskoulutusta ollaan parhaillaan uudistamassa siten, että se palvelisi paremmin sekä nuoria itseään että seurakuntien lapsi-, nuoriso- ja perhetyötä.

Yksittäisissä seurakunnissa ei yleensä ole kuin kourallinen nuoria, ja toisaalta matkat valtakunnallisiin tapahtumiin ovat pitkät ja kalliit. Alueelliset temaattiset nuorten viikonloput, «minileirit», tarjoavat mahdollisuuden kokoontua lähellä edes silloin tällöin.